Nach jeder Mission gibt es eine Gesamtauswertung. In diese Wertung sind auch alle Nebenmissionen des jeweiligen Kapitels inkludiert. Die Nebenmissionen beeinflussen auch, wieviel Gil du am Ende der Mission erhältst.

Die Nebenmissionen sind keineswegs verpflichtend. Du kannst sie also auslassen, bzw. einfach ignorieren. Es gibt auch Nebenmissionen, die am Ende der Mission nicht angeführt werden. Die Belohnung für solche Nebnmissionen bekommst du dann unmittelbar nach Beendigung der selbigen.

- Beschütze die Zivilisten

Töte alle Deep Ground Soldaten, bevor sie die Zivilisten umbringen. Es befinden sich 25 Zivilisten in der ganzen ersten Mission.

- Rette das entführte Mädchen

Öffne den Kontainer und töte die Gegner die sich in und um ihn befinden. Das Mädchen wird dann automatisch gerettet.

- Finde die Schlüsselkarte

Finde alle 5 Schlüsselkarten die sich in der Mission befinden.

- Helfe den WRO Mitgliedern

Es gilt, 12 WRO Soldaten durch ein paar Kämpfe gegen die Deep Grounds zu führen.

- Rotte die Wachhunde aus

Während du mit dem WRO Transporter unterwegs bist, musst du so viele Biester wie möglich ausschalten. Insgesamt gibt es 70 Stück von ihnen.

- Beschütze das Kind

Beschütze den Jungen, während er dich zu einer Schlüsselkarte führt.

- Eliminiere alle Scharfschützen

Töte alle 15 Scharfschützen, die sich in dieser Mission verstecken.

- Helfe den WRO Mitgliedern

Du musst 20 WRO Soldaten beschützen. Schalte dazu einfach immer alle Deep Grounds in ihrer Umgebung aus.

- Eile zur Kommandozentrale

Die Zeit läuft. Folge dem verwinkelten Gang zur Kommandozentrale. Den besten Rang bekommst du, wenn du unter einer Minute bleibst.

- Töte alle Gegner

Nachdem du Azul gesehen hast, kannst du durch eine Türe gehen. Dort kommen von allen Seiten Gegner auf dich zu. Benutze die Maschinengewehrbatterie, um sie alle fertig zu machen.

- Eliminiere die Sahagin

Insgesamt begegnern dir 45 Sahagin im Abwasserkanal, unterhalb der Shinravilla. Schalte sie alle aus.

- Schleiche dich an den DG Soldaten vorbei!

Du musst dich mit Cait Sith an einigen DG Soldaten vorbeischleichen. Benutze auch die hochexplosiven Fässer, um die Soldaten auszuschalten.

- Sammle alle Omega Berichte ein!

#1 holt sich Vincent noch während der Zwischensequenz.

#2 kannst du bei den Koordinaten B-7 im Bibliotheksbereich holen.

#3 bekommst du im ersten Stock der Shinravilla, unter den Koordinaten B-7.

#4 findest du im Erdgeschoss der Shinravilla, hinter dem Bücherregal bei J-10

- Deaktiviere alle Minen!

Kommst du in die Nähe einer Mine, wird sie Sichtbar. Löse sie mit einem Schuss aus.

- Zerstöre alle Helikopter, die das Hauptquartier angreifen!

Es kommen 15 Helikopter auf das Hauptquartier zu. Benutze die Maschinengewehrbatterie, um sie alle auszuschalten.

- Rette die WRO Mitglieder!

Schalte alle Deep Grounds aus, die die WRO Mitglieder angreifen. Insgesamt gibt es 12 WRO Soldaten in dieser Mission zu beschützen.

In dieser Mission gibt es keine Nebenmissionen.

- Eskortiere das WRO Squad zum zentralen Komplex!

Zuerst musst du sie retten, dann kannst du alle 5 zum zentralen Komplex geleiten.

- Rette die überlebenden WRO Mitglieder!

Rette alle 9 Soldaten vor den Gegnern.

- Besiegen den Deep Ground Kommandanten!

Töte den Deep Ground Kommandanten und besorge dir seine Schlüsselkarte.

- Weiche den Minen aus!

Du musst 3 Minen abwehren, während du einen Gang durchquerst.

- Zerstöre die Angriffsroboter!

In einem geraden Gang rast ein Angriffsroboter auf dich zu. Benutze deine Schusswaffen und besonders deine Sturmmateria, um ihn zu zerstören.

- Helfe den WRO Mitgliedern!

3 WRO Soldaten versuchen 40 Sperren aufzuheben, um eine Energiebarriere zu deaktivieren. Deep Ground Soldaten tauchen auf und versuchen die Soldaten auszuschalten. Wird der erste Soldat getötet, nimmt der zweite den Platz ein. Wird dieser ebenfalls getötet, nimmt der dritte und letzte WRO Soldaten den Platz ein.

- Zerstöre alle Miniroboter!

Es sind insgesamt 10 Roboter.

- Sammel alle streng geheimen Deep Ground Akten ein!

Die folgende Karten zeigen alle 5 Akten.

- Zerstöre die Überwachungsdrohnen!

Sie schwirren während 2 Liftfahrten um dich herum. Schalte alle 99 Stück in der Mission aus.

- Eliminiere die Verfolger!

Während der Fahrt nehmen dich 9 Deep Grounds und ein Dragonfly unter Beschuss.

- Beende schnell den gegnerischen Angriff!

Töte alles, was sich dir in den Weg stellt. Benutze dafür die Maschinengewehrbatterie.

- Besiege 100 Gegner

Innerhalb des großen Raumes warten 100 Gegner auf dich. Du kannst die Mission beenden, indem du den Raum einfach wieder verlässt. Als Belohnung gibt es einen goldenen Moogle. Du kannst ihn um 35.000 Gil verkaufen.

- Sammle 4 Items

* Gehe Links in das Kanalrohr und Vincent wird selbst akkustisch mitteilen, wann der Zeitpunkt gekommen ist nach oben zu schauen. Du wirst eine kleine Bombe sehen, in der sich eine Schlüsselkarte befindet.

* Gehe dann weiter bis du oben zur Maschinengewehrbatterie kommst. Besteige sie und links wirst du eine Kiste erkennenn die du unter Beschuss nimmst. Sie purzelt nach unten. Laufe zurück und hole dir den Inhalt der Kiste. Eine Schlüsselkarte.

* Stelle dich dann neben der Maschinengewehrbatterie auf und ziele mit deinem Scharfschützenvisier auf die rechte Seite der Ruine. Du wirst eine kleine schwarze Bombe sehen, die du herunterschießt. Gehe dann wieder zurück und knacke die Bombe. Du bekommst eine weitere Schlüsselkarte.

* Eine weitere Schlüsselkarte bekommst du, wenn du bei der Maschinengewehrbattiere das nächste Gebäude betrittst. Du kommst in einen Kanal und musst eine Leiter hinaufklettern. Dir wird eine schwebende Schlüsselkarte auffallen, die du dir mit einem Sprung von oben holen kannst.

* Gehe dann weiter und du kommst zu einem Shopautomaten. Hinter diesem kommt eine weitere Schlüsselkarte zum Vorschein.

* Zerstöre die Kiste, die sich neben dem Shopautomaten befindet und eine weitere Schlüsslkarte ist dein.

* Springe dann in Richtung Norden nach unten und nähere dich bei G-6 dem kleinen Abgrund. Achte besonders darauf, dass du nicht runterfliegst, denn es gibt kein Zurück. Nähere dich ganz langsam dem Abgrund und du wirst eine weitere Schlüsselkarte bekommen.

* Gehe dann wieder dorthin zurück, wo diese Mission begonnen hat. Dort siehst du eine Energiebarriere hinter der sich 2 Schlüsselkarten befinden. Deaktiviere sie und hole dir beide Schlüsselkarten.

Du hast nun genügend Schlüsselkarten, um alle Energiebarrieren zu deaktivieren. Gehe zuerst zu der Stelle wo die 7 Energiebarrieren zu finden sind. Deaktivere sie alle und du bekommst einen Waffenlauf und 2 weitere Schlüsselkarten.

Deaktiviere nun alle anderen Energiebarrieren und sammel nützliche Items ein.

- Besiege die Gargoyles I!

Es handelt sich um 2 fliegende Gargoyles. Schieße sie einfach ab.

- Besiege die Gargoyles II!

Es handelt sich um 3 fliegende Gargoyles. Schieße sie einfach ab.

- Besiege alle Gegner auf der Hauptstütze!

8 Gegner befinden sich auf einem Rondo und schießen auf dich. Es handelt sich um Deep Grounds mit Schutzschildern und Raketenwerfern. Versuche sie mit den hochexplosiven Fässern auszuschalten.

- Besiege die Gargoyles III!

Diesmal handelt es sich um 9 Gargoyles. Du kannst die Maschinengewehrbatterie benutzen, die sich etwas weiter unten im Raum befindet.

In dieser Mission gibt es keine Nebenmissionen.