Nach einem kurzen Gespräch mit Zack's Freund Kunsel wird er im Hauptquartier ShinRa's mit Lazard, einem hohen ShinRa-Angestellten der zuständig für die SOLDIER ist, bekannt gemacht. Wenig später erfährst du das Ziel deiner nächsten Mission mit Angeal: Der verschollene Rang 1 SOLDIER Genesis soll in der Wutai-Region ausfindig gemacht werden. Kunsel kommt herein, um dir einen weiteren Teil beizubringen. Sprich ihn an, wähle die obere Option und folge ihm in den anderen Teil des Raumes. Wähle den Monitor an, den Zack's Freund dir zeigt und laufe hinüber zum Speicherpunkt. Öffne das Menü und benutze die Option "Missionen", wo du als Einstieg in einem simplen Kampf gegen ShinRa-Soldaten antrittst(im Storyverlauf, bzw. wenn du bestimmte Missionen dieses Untermenüs erledigt hast, kommen immer wieder neue hinzu; je nachdem wie hoch Zack's Ebene ist, unterscheiden sie sich zwischen "Sehr leicht", "leicht", "Normal", "Schwer" und "Sehr schwer"; die Missionen können sehr gut zum Training, sowie dem Sammeln der Gil und Objekte benutzt werden; hin und wieder während der Story einen kleinen Stopp einzulegen und neu hinzugefügte, bzw. alte Missionen wieder anzutreten, kann sehr hilfreich sein, allgemein ist es auch sehr hilfreich sich in den Läden die einem im Meü zur Verfügung stehen, wieder neu auszustatten; besonders mit kostbaren "Äther"-Objekten, sofern man sich hauptsächlich auf die effektive Kampfart des Zauberns verlässt; neue Läden werden dir durch das Weiterführen der Story und das Meistern gewisser Nebenmissionen aus der Menü-Option "Missionen" zur Verfügung gestellt). Ist er vorüber, sprich Kunsel an, um eine Mail zu erhalten, die du im Menü unter "Mail" liest(das Tutorial welches dir die Grundzüge erklärt ist ebenfalls bereits in Mails zusammengefasst; Zack bekommt während des Storyverlauf immer wieder Mails von bestimmten Personen) von öffne das Fach 6 neben dem Kunsel steht, um dein erstes Zubehör zu erhalten, den "Bronze-Reif". Im weiteren Storyverlauf solltest du mit Zack immer wieder hierher zurückkehren wenn es dir möglich ist, um weitere Objekte den Fächern zu entnehmen. Wenn du jetzt das Fach noch weitere 20 Male zu öffnen versuchst, erhältst du von Kunsel den "Fluchring". Bist du fertig, speichere evtl. noch und laufe zurück zu Angeal. Stimme mit der oberen Option zu die richtige Mission zu beginnen und ihr zieht los.

Nahe einer Festung Wutai's angekommen, läufst du weiter nach vorne und bekämpfst die sich in den Weg stellenden Wutai-Soldaten und hörst einem Gespräch zwischen Angeal und Zack über den Banora-Apfel zu. Gehe dann weiter, speichere evtl. am Speicherpunkt vor dem Screenende und betritt das nächste Bild. In Deckung gehend und sich auf das ihnen Bevorstehende vor. Kurz nachdem Zack seinem Mentor eine Frage über seine Waffe, das Meisterschwert stellt, beginnt seine eigentliche Aufgabe. Erledige vor dem Tor die Soldaten; die die auf der Mauer die Kanonen bedienen, mit Zaubern(nach geraumer Zeit flüchten sie auch). Auf der anderen Seite des Tores bekommst du es mit drei weiteren Wachen zu tun. Nach dem Kampf wird dir dein nächster zu erledigender Auftrag ebenfalls das Auslöschen einer bestimmten Anzahl Gegner sein, bevor du weiterkommst. Laufe durch den Durchgang und öffne die Schatzkiste, vor der du ein weiteres Mal angegriffen wirst, um einen "Soma" zur Wiederherstellung einiger AP zu erhalten. Laufe dann nach rechts, um erneut angegriffen zu werden und unmittelbar danach um die nächste Ecke erwartet dich dann ein Kampf gegen eine dritte Gegnergruppe. Nach dem dritten Kampf rennst du um eine weitere Ecke, um beschossen zu werden. Aus der Deckung gelaufen, laufe weiter nach vorne in Richtung der Gegner. Drei weitere Soldaten kommen aus der Trickwand hinter dir. Besiege sie und benutze ebenfalls die Wand, um die vorherige Gruppe aus dem Hinterhalt zu attackieren. Marschiere nachdem Lazard angerufen hat bis fast zum Tor zurück. In der Nähe steht ein Turm. Wähle ihn an und locke die nächsten Gegner hervor. Danach ruft Lazard erneut an. Dann wieder bis knapp in die Mitte des Screens gelaufen und an der zuletzt erwähnten Trickwand vorbei, findest du eine Schatzkiste mit einer "Potion", sowie eine auffällige Schatzkiste in der Nähe, welche mitten auf dem Platz steht. Öffne sie und deine nächsten Gegner greifen dich an. Die nächsten beiden Durchgänge passiert, wirst du wieder je einmal angegriffen. Laufe nach dem zweiten Durchgang in die Ecke rechts von Zack und bekämpfe die dortigen Gegner. Öffne die Schatztruhe mit dem "Äther" und versuche dich an der dortigen Trickwand, um einen weiteren Kampf zu bestreiten. Verlasse dann die Ecke wieder und sichere dir die "Hi-Potion" aus der Truhe hinter dem Turm. Aus dem Turm selbst kannst du erneut weitere Gegner herauslocken. Um die nächste Ecke gelaufen, erwarten dich weitere schießende Gegner. Stürme nicht auf sie zu, sondern laufe durch den vorherigen Durchgang und benutze dann die Trickwand, um die Gegner zu überraschen. Ihr Anführer flieht und lässt eine "Potion" fallen. Benutzt du die Trickwand noch einmal, greifen dich von der anderen Seite aus weitere Gegner an. Laufe dann in dieselbe Richtung wie der fliehende Soldat und öffne die Truhe rechts vom Tor, um ein "Äther" zu erhalten. Das Tor ansteuernd, erwarten dich deine letzte zu besiegende Gegnergruppe. Schreite durch das Tor in den Hof. Im linken Seitengang findest du einen "Hi-Trank". Im rechten ein "Ohrring"-Zubehör. Speichere in der Mitte des Hofes am Speicherpunkt und sieh' dir nachdem du deine Mails gelesen hast, die Statue des Brunnens an. Nach einem kurzen Kampf und kannst du die Treppe hinauf, um ein vielleicht bekanntes Gesicht zu sehen und durch die Tür gehend, erwartet dich ein kurzer Zwischenkampf gegen die Anti-SOLDIER-Gegner...

Ifrit's Auftritt endet mit einem einfachen Schwertstreich Sephiroth's. Dem jungen immernoch beeindruckten SOLDIER werden von ihm die Gesichter der Soldaten offenbart: Genesis-Klone. Sephiroth erklärt mit einem Verdacht das plötzliche Verschwinden Angeal's und mit Zack's Unglauben endet das erste Kapitel.